Ce projet consiste en l'amélioration d'une infrastructure technologique. L’objectif est de concevoir une architecture logicielle pour aider les utilisateurs à mieux gérer le traitement des données d’imagerie médicale dont ils disposent. Des composantes du pipeline de données médicales ont été développées et de nouvelles fonctionnalités ont été ajoutées, notamment afin d'assurer le respect des règles éthiques en milieu hospitalier. En somme, le projet vise à faciliter le traitement des données d'imagerie médicale par l'entremise de l’automatisation.

Devant la décision de faire ou non le dépistage prénatal des trisomies 21, 18 et 13, il est important que les femmes enceintes et leurs partenaires soient informés et accompagnés par leurs professionnels de la santé. Les impliquer dans la prise de décision partagée (PDP) permettrait de répondre à leurs besoins décisionnels. Aussi, l’utilisation d’un outil d’aide à la décision (OAD) faciliterait la PDP.

Le projet de Rose-Marie porte sur l’analyse des interactions entre bactériophages – les virus des bactéries – et bactéries du microbiote intestinal à partir de jeux de données issus d’expérimentations réalisées par l’étudiante, en collaboration avec des membres de l’Institut sur la Nutrition et les Aliments Fonctionnels (INAF) de l’Université Laval. Le premier objectif est d’étudier l’impact des phages sur les dynamiques bactériennes dans un microbiote simplifié, composé de 8 souches bactériennes clés du microbiote intestinal humain.

Le projet d’Alexandre Boulay porte sur l’analyse des phages et bactéries du microbiote intestinal à partir d’un jeu de données métagénomiques de l’Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels (INAF) de l’université Laval, par des méthodes bio-informatique et d’intelligence artificielle (IA).

Le stagiaire a développé un outil de conversion de données d’annotation de nodules pulmonaires enregistrés dans des fichiers HDF5 vers le format de fichier DICOM. L’outil permet d’effectuer l’extraction des données d’annotation dans le fichier HDF5 ainsi que les données de tomodensitométrie des poumons des patients enregistrés dans une banque de données. Ensuite, l’outil génère et enregistre un fichier d’annotation DICOMen suivant la structure indiquée par le DICOM Standard Browser.

Issu du milieu de la recherche avec un intérêt marqué pour la gestion des données ? ==> Cette offre d'emploi pourrait vous intéresser :

Lieu de travail
Vice-rectorat à la recherche, à la création et à l'innovation
Pavillon des sciences de l'éducation
 

Statut/Admissibilité
Affectation temporaire ou contrat temporaire
Ouvert à tous
 

Détails du poste