Étudiant.e
Directeur.e(s) de recherche
Philippe Després
Début du projet
Titre du projet de recherche
Conversion de fichiers de segmentation HDF5 à DICOM
Description

Le stagiaire a développé un outil de conversion de données d’annotation de nodules pulmonaires enregistrés dans des fichiers HDF5 vers le format de fichier DICOM. L’outil permet d’effectuer l’extraction des données d’annotation dans le fichier HDF5 ainsi que les données de tomodensitométrie des poumons des patients enregistrés dans une banque de données. Ensuite, l’outil génère et enregistre un fichier d’annotation DICOMen suivant la structure indiquée par le DICOM Standard Browser. L’étudiant a programmé cet outil en python tout en effectuant un suivi des versions à l’aide de Gitlab.

Le projet du stagiaire a permis la conversion d’une centaine de patients. Finalement, l’outil pourra être réutilisé par d’autres membres du groupe de recherche à l’avenir pour d’autres projets nécessitant une conversion de données d’annotation vers DICOM.

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