Le projet de Rose-Marie porte sur l’analyse des interactions entre bactériophages – les virus des bactéries – et bactéries du microbiote intestinal à partir de jeux de données issus d’expérimentations réalisées par l’étudiante, en collaboration avec des membres de l’Institut sur la Nutrition et les Aliments Fonctionnels (INAF) de l’Université Laval. Le premier objectif est d’étudier l’impact des phages sur les dynamiques bactériennes dans un microbiote simplifié, composé de 8 souches bactériennes clés du microbiote intestinal humain. Le deuxième objectif est d’étudier les dynamiques bactéries-phages dans un microbiote complexe représentatif du microbiote intestinal humain. Pour les deux objectifs, suite aux expérimentations et à l’acquisition des données de séquençage, Rose-Marie effectuera l’analyse des données par méthodes bio-informatiques. Ce projet pourrait avoir d’importantes retombées pour la compréhension des interactions entre bactéries et phages qui sont très peu connues, mais aussi pour les connaissances sur le microbiote intestinal en lien avec la nutrition et la santé des individus.