Étudiant.e
Directeur.e(s) de recherche
Elsa Rousseau
Début du projet
Titre du projet de recherche
Étude des interactions bactéries-phages du microbiote intestinal chez la population générale québécoise
Description

Le projet d’Alexandre Boulay porte sur l’analyse des phages et bactéries du microbiote intestinal à partir d’un jeu de données métagénomiques de l’Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels (INAF) de l’université Laval, par des méthodes bio-informatique et d’intelligence artificielle (IA). Le jeu de données provient d’une étude récente ayant examiné l'interaction de l'axe endocannabinoïde avec les facteurs environnementaux de l'hôte ainsi que l'état de santé intestinal, métabolique et mental chez des adultes québécois présentant divers statuts métaboliques et modes de vie. L’objectif général est d’entraîner des algorithmes d’IA interprétables afin d’identifier des phages et bactéries biomarqueurs de la santé métabolique et mentale des individus, et étudier les interactions entre bactéries et phages. Ce projet pourrait avoir d’importantes retombées pour la compréhension des interactions entre bactéries et phages qui sont très peu connues, mais aussi pour les connaissances sur le microbiote intestinal de la population québécoise en lien avec leur santé métabolique et mentale.

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